Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms