Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col24a1Q30D77 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col24a1Q30D77 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Col24a1Q30D77 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col24a1Q30D77 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col24a1Q30D77 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col24a1Q30D77 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col24a1Q30D77 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col24a1Q30D77 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col24a1Q30D77 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col24a1Q30D77 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col24a1Q30D77 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col24a1Q30D77 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col24a1Q30D77 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col24a1Q30D77 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col24a1Q30D77 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col24a1Q30D77 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Col24a1Q30D77 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col24a1Q30D77 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col24a1Q30D77 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col24a1Q30D77 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms