Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd11Q1RNF8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms