Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3ip1Q149C2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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