Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms