Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rundc1Q0VDN7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms