Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms