Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rab42Q0PD08 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rab42Q0PD08 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms