Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms