Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spata18Q0P557 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spata18Q0P557 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms