Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NeblQ0II04 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NeblQ0II04 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms