Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700061G19RikQ08EE8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms