Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms