Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gata4Q08369 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms