Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Cnn1Q08091 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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