Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms