Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms