Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Siah2Q06986 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Siah2Q06986 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms