Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms