Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms