Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms