Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcr5Q04683 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms