Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CkbQ04447 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CkbQ04447 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CkbQ04447 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms