Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms