Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms