Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms