Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms