Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms