Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GabpaQ00422 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms