Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PgrQ00175 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PgrQ00175 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PgrQ00175 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PgrQ00175 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PgrQ00175 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PgrQ00175 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PgrQ00175 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PgrQ00175 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PgrQ00175 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PgrQ00175 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PgrQ00175 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PgrQ00175 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PgrQ00175 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PgrQ00175 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PgrQ00175 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PgrQ00175 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PgrQ00175 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PgrQ00175 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PgrQ00175 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PgrQ00175 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PgrQ00175 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PgrQ00175 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PgrQ00175 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PgrQ00175 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PgrQ00175 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PgrQ00175 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PgrQ00175 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PgrQ00175 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PgrQ00175 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PgrQ00175 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PgrQ00175 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PgrQ00175 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PgrQ00175 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms