Protein–RNA interactions for Protein: P97950

Rab33a, Ras-related protein Rab-33A, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33aP97950 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab33aP97950 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab33aP97950 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab33aP97950 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab33aP97950 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab33aP97950 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab33aP97950 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab33aP97950 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab33aP97950 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab33aP97950 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab33aP97950 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab33aP97950 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab33aP97950 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab33aP97950 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab33aP97950 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab33aP97950 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab33aP97950 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab33aP97950 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab33aP97950 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab33aP97950 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab33aP97950 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab33aP97950 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab33aP97950 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab33aP97950 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab33aP97950 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab33aP97950 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms