Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AlkP97793 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AlkP97793 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AlkP97793 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AlkP97793 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AlkP97793 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AlkP97793 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AlkP97793 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AlkP97793 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AlkP97793 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AlkP97793 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AlkP97793 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AlkP97793 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AlkP97793 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AlkP97793 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AlkP97793 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AlkP97793 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AlkP97793 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AlkP97793 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AlkP97793 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AlkP97793 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AlkP97793 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AlkP97793 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AlkP97793 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AlkP97793 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AlkP97793 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AlkP97793 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AlkP97793 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
AlkP97793 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AlkP97793 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AlkP97793 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AlkP97793 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AlkP97793 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AlkP97793 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AlkP97793 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AlkP97793 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AlkP97793 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AlkP97793 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AlkP97793 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AlkP97793 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AlkP97793 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AlkP97793 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AlkP97793 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AlkP97793 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AlkP97793 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AlkP97793 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AlkP97793 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AlkP97793 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AlkP97793 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AlkP97793 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AlkP97793 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AlkP97793 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AlkP97793 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AlkP97793 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AlkP97793 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AlkP97793 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlkP97793 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlkP97793 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlkP97793 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlkP97793 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlkP97793 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlkP97793 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AlkP97793 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlkP97793 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlkP97793 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlkP97793 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlkP97793 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlkP97793 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlkP97793 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlkP97793 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlkP97793 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlkP97793 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlkP97793 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlkP97793 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlkP97793 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlkP97793 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlkP97793 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AlkP97793 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AlkP97793 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AlkP97793 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AlkP97793 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AlkP97793 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AlkP97793 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AlkP97793 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AlkP97793 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AlkP97793 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AlkP97793 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AlkP97793 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AlkP97793 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AlkP97793 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AlkP97793 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AlkP97793 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AlkP97793 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlkP97793 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlkP97793 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlkP97793 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AlkP97793 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AlkP97793 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlkP97793 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AlkP97793 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms