Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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