Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry1P97784 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry1P97784 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry1P97784 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms