Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pitx2P97474 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms