Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vgll3P85442 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll3P85442 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms