Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx1P82976 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx1P82976 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx1P82976 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx1P82976 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx1P82976 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx1P82976 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx1P82976 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx1P82976 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx1P82976 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx1P82976 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx1P82976 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx1P82976 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx1P82976 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx1P82976 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbx1P82976 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbx1P82976 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms