Protein–RNA interactions for Protein: P80316

Cct5, T-complex protein 1 subunit epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct5P80316 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cct5P80316 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cct5P80316 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cct5P80316 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms