Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ctps1P70698 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms