Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeboxP70368 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeboxP70368 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeboxP70368 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SeboxP70368 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms