Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tbx6P70327 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tbx6P70327 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tbx6P70327 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbx6P70327 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tbx6P70327 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tbx6P70327 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbx6P70327 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbx6P70327 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbx6P70327 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tbx6P70327 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbx6P70327 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbx6P70327 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tbx6P70327 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbx6P70327 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbx6P70327 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbx6P70327 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbx6P70327 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbx6P70327 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbx6P70327 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tbx6P70327 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tbx6P70327 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbx6P70327 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tbx6P70327 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tbx6P70327 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tbx6P70327 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbx6P70327 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbx6P70327 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tbx6P70327 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbx6P70327 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tbx6P70327 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tbx6P70327 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tbx6P70327 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tbx6P70327 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbx6P70327 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tbx6P70327 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbx6P70327 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbx6P70327 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tbx6P70327 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tbx6P70327 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbx6P70327 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbx6P70327 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbx6P70327 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbx6P70327 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbx6P70327 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tbx6P70327 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tbx6P70327 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tbx6P70327 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tbx6P70327 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tbx6P70327 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tbx6P70327 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tbx6P70327 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tbx6P70327 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tbx6P70327 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tbx6P70327 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tbx6P70327 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tbx6P70327 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tbx6P70327 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tbx6P70327 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tbx6P70327 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tbx6P70327 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tbx6P70327 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tbx6P70327 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tbx6P70327 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tbx6P70327 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tbx6P70327 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tbx6P70327 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tbx6P70327 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tbx6P70327 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tbx6P70327 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tbx6P70327 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tbx6P70327 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tbx6P70327 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tbx6P70327 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tbx6P70327 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tbx6P70327 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tbx6P70327 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tbx6P70327 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tbx6P70327 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tbx6P70327 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tbx6P70327 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tbx6P70327 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tbx6P70327 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tbx6P70327 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tbx6P70327 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tbx6P70327 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tbx6P70327 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tbx6P70327 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tbx6P70327 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tbx6P70327 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tbx6P70327 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tbx6P70327 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tbx6P70327 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tbx6P70327 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tbx6P70327 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tbx6P70327 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tbx6P70327 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tbx6P70327 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tbx6P70327 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tbx6P70327 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms