Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cux2P70298 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cux2P70298 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cux2P70298 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cux2P70298 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cux2P70298 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cux2P70298 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cux2P70298 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms