Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sycp3P70281 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms