Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rad54lP70270 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms