Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms