Protein–RNA interactions for Protein: P70194

Clec4f, C-type lectin domain family 4 member F, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4fP70194 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4fP70194 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec4fP70194 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms