Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms