Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tra2bP62996 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms