Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps3P62908 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps3P62908 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps3P62908 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3P62908 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps3P62908 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms