Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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